مهدی توتونچی در سال 1386 وقتی 28 ساله بود با نیلوفر اردلان بازیکن فوتبال زنان که آن زمان 22 سال داشت ازدواج کرد که ثمره این زندگی یک پسر بنام رادان می باشد.
مهدی توتونچی برای دومین بار در 1 اسفند 1399 در سن 41 سالگی با مبینا نصیری مجری که آن زمان 31 سال داشت ازدواج کرد. در سال 1396 مبینا نصیری اعلام کرد که 8 ماه است عاشق شده و بزودی قرار است که با یک مجری سرشناس ازدواج کند که سه سال بعد این اتفاق افتاد!
